Rosetta和PyRosetta的安装与使用指南
本资源文件提供了关于Rosetta和PyRosetta的详细安装与使用指南。Rosetta是一款用于蛋白质结构预测和蛋白质设计的软件包，而PyRosetta是Rosetta的Python接口，允许用户使用Python语言调用Rosetta的功能。
内容概述
- Rosetta的安装
- 下载Rosetta
- 安装和编译Rosetta
- 配置环境变量
- PyRosetta的安装
- 下载PyRosetta
- 解压安装
- 配置Python环境
- 使用教程
- Rosetta的基本操作
- PyRosetta的基本操作
- 常见问题及解决方案
安装步骤
1. Rosetta的安装
下载Rosetta
- 从官方网站下载Rosetta软件包，需要学术账号和密码。
- 也可以通过百度网盘下载，密码为
0hoe。
安装和编译Rosetta
- 安装依赖：OPENMPI、BOOST、Python2.7
- 编译Rosetta：使用
gcc编译，命令为./scons py -j 4 mode=release bin extras=mpi
配置环境变量
- 编辑
~/.bashrc文件，添加Rosetta的路径 - 使配置生效：
source ~/.bashrc
2. PyRosetta的安装
下载PyRosetta
- 从官方网站下载PyRosetta软件包，密码为
fe72。
解压安装
- 解压文件：
tar -vjxf PyRosetta4_Debug_python27_ubuntu_release-185.tar.bz2 - 安装：
sudo python setup.py install
3. 使用教程
Rosetta的基本操作
- 启动Rosetta并进行蛋白质结构预测
- 使用Rosetta进行蛋白质设计
PyRosetta的基本操作
- 在Python环境中导入PyRosetta模块
- 使用PyRosetta进行蛋白质结构预测和设计
常见问题及解决方案
- 安装过程中可能遇到的错误及解决方法
- 使用过程中常见问题的解决方案
总结
本资源文件详细介绍了Rosetta和PyRosetta的安装与使用方法，适合初学者和进阶用户参考。通过本指南，您可以顺利安装并开始使用Rosetta和PyRosetta进行蛋白质结构预测和设计。