UNet大脑MRI海马体语义分割

2021-06-11

U-Net:大脑MRI海马体语义分割

简介

本资源文件提供了关于U-Net网络在大脑MRI图像中海马体语义分割的详细实现和应用。U-Net是一种在医疗领域进行语义分割时效果优异的深度学习网络结构,特别适用于处理医学图像数据。

内容概述

  1. 数据集
    • 大脑MRI数据集源于Kaggle平台,包含100个病人的大脑MRI图像。
    • 每张MRI图像对应的海马体分割结果存储在文件夹中。
    • 从原数据集中随机抽取150张大脑MRI图像及其对应的分割结果图像,作为实验数据集。
  2. 自定义Dataset
    • 在Pytorch中,通过DataLoader完成数据的批量导入。
    • 继承Dataset类并实现自定义数据集,关键代码包含数据增强和图像处理。
  3. 构建U-Net网络
    • U-Net网络由4个下采样层、4个上采样层以及若干卷积层构成。
    • 卷积单元、下采样层和上采样层的定义和实现。
  4. 训练与预测
    • 定义数据加载函数,将数据集封装入DataLoader。
    • 训练函数和预测函数的实现,包括网络训练和预测结果的存储。

使用说明

  1. 数据准备
    • 下载并解压数据集,确保数据集路径正确。
    • 根据需要调整数据增强和预处理步骤。
  2. 网络训练
    • 运行训练脚本,设置合适的超参数(如学习率、批量大小等)。
    • 监控训练过程中的损失变化,调整模型参数以优化性能。
  3. 预测与评估
    • 使用训练好的模型进行预测,生成海马体分割结果。
    • 评估预测结果的准确性,进行必要的调整和优化。

依赖环境

  • Python 3.x
  • Pytorch
  • OpenCV
  • NumPy

贡献

欢迎对本项目进行改进和扩展,提交Pull Request或Issue以贡献您的想法和代码。

许可证

本项目遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处声明。

下载链接

U-Net大脑MRI海马体语义分割分享