Neo4j导入Protege的OWL文件指南

本文档旨在提供一个详细的指南，帮助用户将Protege导出的OWL文件导入到Neo4j数据库中。通过本指南，您将了解如何准备OWL文件、配置Neo4j环境以及执行导入操作。

目录

1. 前言
2. Protege导出OWL文件
3. Neo4j导入OWL文件
4. 两种导入方法对比
5. 总结

前言

Protégé软件是斯坦福大学医学院生物信息研究中心基于Java语言开发的本体编辑和知识获取软件，而Neo4j是一个高性能的图形数据库。本文将介绍如何将Protege中的本体以图的形式在Neo4j中展示。

Protege导出OWL文件

参考相关教程，Protege导出的OWL文件格式为‘RDF/XML’。您可以直接导出该类型文件，其他类型文件未测试。

Neo4j导入OWL文件

3.1 下载相关jar包

1. 下载扩展neosemantics jar包，并将其复制到neo4j/plugins目录下。
2. 确保neosemantics jar包与Neo4J版本相匹配。
3. 修改配置文件：在neo4j/neo4j.conf文件中添加以下内容：

   dbms.unmanaged_extension_classes=semantics.extension=/rdf
   

4. 重新启动Neo4j。
5. 访问web端Neo4j并登录，查看列表中是否包含可扩展的rdf、owl。

3.2 两种导入方法对比

方法一：直接导入OWL文件（不可取）

• 导入命令：

  CALL semantics.liteOntoImport('file:///C:/Users/user/Desktop/creature.owl', 'RDF/XML')
  

• 结果：只成功加载了19个元素，无实例。

方法二：将OWL文件转换成RDF文件再导入

1. 使用rdf2rdf-1.0.1-2.3.1.jar包将OWL文件转换成RDF文件。
2. 导入命令：

   CALL semantics.importRDF('file:///C:/Users/user/Desktop/creature.turtle', 'RDF/XML', [])
   

3. 结果：虽然能将实例导入，但原OWL文件的实例与所属类的关系不存在，实例的属性信息不存在，会多出几个不被需要的节点。

总结

综上所述，第二种方法更可靠一些，但也并不完美，还需人工操作Neo4j以达到预期图库。掌握了规律会使工作更流畅。

希望本指南对您有所帮助！

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Neo4j导入Protege的OWL文件指南